Elke winter worden de vleermuizen in de winterverblijven op de Kop van Schouwen geteld. Deze dieren zijn dan in winterslaap en kunnen dan eenvoudig geteld worden. Maar dat geldt niet voor alle soorten. Er zijn ook vleermuizen die overwinteren in spouwmuren of boomholtes waardoor zijn deze niet te inventariseren zijn tijdens hun winterslaap. Het betreden van een winterverblijf en het tellen gebeurt volgens strenge regels, opgesteld door het Ministerie van Landbouw, Natuurbeheer en Voedselkwaliteit, in verband met de beschermde status van de vleermuis. Eenmaal in het winterverblijf worden ook andere dieren geteld, waaruit blijkt dat deze kelders, bunkers en andere gebouwen in natuurgebieden een zeer belangrijke functie hebben voor diersoorten om te overwinteren.